Peinkiher je namreč v intervjuju v ponedeljkovem Delu zatrdil, da je bil Janez Janša tisti, ki je leta 1990 razoroževal Slovenijo. Prav tako naj bi z nestrokovnim delom ogrozil proces osamosvajanja ter zlorabljal vojsko in varnostno službo v politične namene.
Janša, njegov namestnik Miran Bogataj in šef varnostne službe Andrej Lovšin naj bi z nestrokovnim delom zelo ogrozili proces osamosvajanja Slovenije. Kot je dejal Peinkiher, je bilo vpoklicanih okoli 15.000 rezervistov TO in več tisoč rezervistov policije, a 27. junija 1991 zjutraj, ko je šla vojska JLA iz vojašnic, na položajih ni bilo nobene enote.
"To je bil popolni debakel obrambnega ministra Janše in notranjega ministra Igorja Bavčarja. Dejstvo, da so bili tisto noč ob 2.45 doma, in ne na svojih mestih, dokazuje, da so povsem podcenjevali razmere, da niso upoštevali opozoril in poročil. Že samo zaradi tega bi morali biti takrat odstavljeni in kaznovani," je še dejal Peinkiher.
Janša odgovarja Peinkiherju: Med vojno je doma spal le vrhovni poveljnik Kučan
"Med vojno je doma spal le vrhovni poveljnik Milan Kučan. Sejo predsedstva RS je sklical šele 12 ur potem, ko so tanki šli iz vojašnic," se je predsednik SDS Janez Janša na družbenem omrežju Twitter odzval na izjave nekdanjega vodje obveščevalnega oddelka na obrambnem ministrstvu Antona Peinkiherja v Delu.