Ambrožič naj bi v svojem magisteriju prepisal večino tuje diplome, ne da bi jo navedel kot vir. Analiza, ki jo je s posebnim programom opravila mariborska fakulteta za računalništvo, je pokazala, da je v poslančev magisterij skoraj v celoti vdelana diploma študentke ljubljanske ekonomske fakultete iz leta 2002.
A Ambrožič poudarja, da je magistrsko delo njegovo avtorsko delo in ne plagiat. Po njegovih besedah mu je Milan Ojstršek s fakultete za računalništvo potrdil, da omenjeni računalniški program zgolj primerja besedila in ne ugotavlja plagiatorstva. O plagiatorstvu morajo po besedah Ambrožiča odločati strokovnjaki, ki se spoznajo na obravnavano tematiko.
V podobnem položaju se je v tem mandatu že znašel Ivan Simčič, ki je po očitkih o ponarejenem srednješolskem spričevalu moral zapustiti poslansko skupine DeSUS in ostal nepovezani poslanec. Kot nepovezani poslanec trenutno deluje tudi nekdanji poslanec DL Ivan Vogrin, vendar ta zaradi očitkov o dolgovih njegovega podjetja.
Pozitivna Slovenija danes odloča o usodi poslanca Ambrožiča
Svet stranke Pozitivna Slovenija bo danes odločal o tem, ali bo Borut Ambrožič, ki naj bi v svojem magisteriju prepisal večino tuje diplome, ostal njihov poslanec. Ambrožič, ki bo danes svetu stranke predstavil svoja stališča, očitke o prepisovanju zanika, sam pa o odstopu ne razmišlja.