Pintar je na mesto državnega sekretarja prišel v času, ko je ministrstvo za zdravje po odstopu nekdanjega ministra Danijela Bešiča Loredana začasno vodil premier Robert Golob, ostal pa je tudi v času aktualne ministrice Valentine Prevolnik Rupel.
Na ministrstvo je prišel z mesta direktorja Združenja zdravstvenih zavodov Slovenije kot poznavalec slovenskega zdravstvenega sistema z dolgoletnimi izkušnjami iz gospodarstva, javne uprave in zdravstva in je veljal tudi za enega od možnih kandidatov za ministra.
Na ministrstvu za zdravje je bil zadolžen zlasti za področje investicij in sprememb zdravstvenega sistema.
Odstopil državni sekretar na ministrstvu za zdravje, kaj je razlog
Državni sekretar na ministrstvu za zdravje Marjan Pintar je iz zdravstvenih razlogov odstopil s funkcije, so za STA potrdili na ministrstvu za zdravje. Ministrstvo tako za zdaj ostaja z dvema državnima sekretarjema, Iztokom Kosom in Denisom Kordežem.