Vdova je Krkoviča obtožila, da je z ukazom o sestrelitvi helikopterja nad centrom Ljubljane med osamosvojitveno vojno umoril njenega moža in še enega pripadnika jugovojske. Senat okrožnega sodišča v Ljubljani je njeno zahtevo za preiskavo zoper brigadirja zavrnil z razlago, da je bil helikopter, glede na dejstvo, da je v času spopadov 27.6.1991 letel nad centrom Ljubljane, legitimna tarča.
Krkovič je bil kot poveljnik brigade Moris zadolžen za varovanje najvišjih funkcionarjev Slovenije. Emilija Mrlak bi se lahko zoper ta sklep pritožila na višje sodišče v Ljubljani, vendar tega po besedah naših virov ni storila, tako da je postopek zaključen.